Leptosphaeria maculans fructifie sous forme de pycnides (forme asexuée : Phoma lingam). Ces pycnides d'abord claires puis brunes et globuleuses de 200 à 600 µm de diamètre, libèrent des conidies unicellulaires et hyalines, cylindriques ou ovoïdes (3,5-6 x 0,8-2 µm, figure 1) dans une masse mucilagineuse de couleur rose à rouge vif : les cirrhes (figure 2).

Les pseudothèces (type de périthèce, forme sexuée) produits sur les débris de culture sont globuleux et noirs (300-500 µm). Ils contiennent des asques (130 x 15 µm) renfermant des pseudo paraphyses et 8 ascospores hyalines à 6 cellules (40-55 x 6 µm) (figures 3 et 4).

Ce champignon peut être cultivé et conservé sur milieu artificiel (figure 5).